作者：巴士速攻-呆呆三瑪水(呆呆)
來源：bbs.tgbus.com
二週目流程
一周目通關後讀取存檔就進入二週目，開始地點是自家門前。 這時大木博士會跑過來詢問圖鑑收集情況，要是已捕捉的怪獸達到了60種的話，他就會幫主角升級全國圖鑑。 如果還沒達到的話，先去抓夠60種再來找博士吧。
抓到60種怪獸後去博士的研究所找他升級圖鑑。 這之後再去精靈聯盟，就會被告知冰系天王有事出去了，暫時不能挑戰四大天王了。
從枯葉市坐船來到1島，和島上網絡中心裡的NPC對話，得知新系統的運行還需要一塊紅寶石。 如果在碼頭橋上向下衝浪的話會到達珍寶海濱，使用探測器能發現不少道具。
從1島往右衝浪，踏上光輝之路。 往上走會發現一個山洞，進去是燈火溫泉，在這裡能回复PM狀態。 和上面的一個老爺爺對話，他會給主角HM06碎岩。
繼續往上走，使用衝浪後到達燈火山。 上到山腰後在左面進入山洞，一直往上走，走到頂層後推開石頭可以遇見火焰鳥，盡力收服吧。
下山後在山腳往右走，能看見兩個火箭隊小兵在把守一個洞穴。 擊敗他們後進入洞穴，在最深處發現紅寶石。
回到網絡中心把紅寶石給NPC，他會再拜託主角尋找藍寶石，並且給了主角7島的船票，同時地圖也更新了。 之後就可以在7島間暢行無阻了。
接下來來到4島，一進去就能看見小茂，不過他這回沒有跟主角開打就離開了。 在島上走走發現，原來冰系天王科拿的家就在這裡。
在科拿家右面使用衝浪進入冰爆洞窟，前面的大瀑布暫時上不去，先進入左面的洞穴。 這裡的小塊冰面踩兩下就會掉下去，然後可以用梯子再爬上來。 利用這點到右下角拿到HM07攀瀑，這樣就可以登上大瀑布了。
登上瀑布後來到洞穴深處，發現冰系天王和火箭隊。 幫助科拿擊敗火箭隊小兵後，他們會說出下一個目標5島的火箭隊倉庫。
於是來到5島，往右走來到空地。 擊敗幾個火箭隊小兵後看見了火箭隊的倉庫，但是沒有密碼進不去。 往右面使用衝浪是回憶之塔，不過也沒什麼特別的劇情。
從5島向上沖浪，再往左走有一個小島。 島上的老爺爺會給主角一個怪獸蛋，當然要隊伍裡有空位才行。
繼續往右走到頭是不歸洞穴，裡面能撿到一些道具。 在最深處遇見一個女孩，和她對戰鬥後將她送回家。 之後再和她說話她會要求看一些PM，滿足她的要求的話就會得到道具獎勵。
然後坐船去6島吧，在PC中心會再次遇見小茂，不過也是只說了幾句話就走了。
從6島的右面海灘向上沖浪能到達水之小徑，旁邊能進入標記森林，這裡有很多蟲系PM。 穿過森林的話還可以沖浪到變化洞穴，如果有ecard的話可以在這裡抓到火葉版以外的怪獸，但對於大部分玩家來說是沒什麼用的。
從6島的右面往下走能夠看見一個山洞，不過門關住了。 用居合斬將門打開後進去，按順序掉入上，左，右，下的洞，發現藍寶石。 可剛拿起來就被尾隨的來的NPC搶走了，他留下了一段火箭隊倉庫的密碼後離開了。
再次來到5島的火箭隊倉庫，有了密碼這下可以進去了。 在倉庫右上角找到了之前請藍寶石的NPC，將他擊敗後能拿回藍寶石。
然後回到1島，和網絡中心裡的NPC對話，設備完成。 之後遊戲便可以和寶石版遊戲通信了。
然後坐船來到7島，島的上面有訓練師之塔，玩家可以在這裡挑戰，裡面的訓練家都極其之強。
從7島的橋上一直往下走有個山谷，穿越山谷就能在海上見到橫向排列的7個遺跡，不過直接進去的話裡面是什麼都沒有的。 途中在山谷中間有個山洞，進入洞裡使用怪力，把裡面的大石都推到坑里，這樣遺跡裡就會出現未知圖騰。
這時如果還沒抓三神鳥的玩家趕緊去抓吧。 閃電鳥在無人發電廠，先用飛空飛到地圖最右上角的岩山隧道，然後往上走會發現一個水池，用衝浪沿著水道走就能到無人電廠了，裡面能撿到不少道具。 走到最深處就會看見閃電鳥。
急凍鳥在紅蓮島右面的雙子島上。 先去淺紅市，然後用衝浪向左走到達雙子島，進入後先得使用怪力，將大石頭推到洞裡，最後堵住水道使水流平緩。 然後在最深一層使用衝浪就能看見急凍鳥。
最後，終於到了抓超夢的時候。 先來到華藍市，走過上面的橋後左拐，使用衝浪到達洞口，之前在這裡擋著的人已經離開了。 這裡的怪獸等級比較高，遇敵率也蠻高的，一路上使用碎岩清開道路，最後在最深處見到LV70的超夢。
至此為止任務都完成的差不多了， 這時可以再回精靈聯盟可以挑戰四大天王，他們的隊伍都強化了不少，等級和組隊都有所變化，當然小茂的也是。 四天王的隊伍是冰天王：LV64白海獅+LV66乘龍+LV63鐵甲貝+LV63長毛豬+LV66迷唇姐；格鬥天王：LV65大鋼蛇+LV65大鋼蛇+LV65艾比郎+LV65沙瓦郎+LV68怪力；毒天王：LV66耿鬼+LV65夢妖+LV70耿鬼+LV68叉字蝠+LV68阿柏怪；龍天王：LV68暴鯉龍+LV66海馬龍+LV70化石翼龍+ LV72快龍+ LV66快龍。
勝利之後依舊是進入榮譽殿堂，然後就是通關畫面。
二週目結束，朝著全圖鑑繼續努力吧！